学校心理咨询是为学生心理健康服务的，学校心理咨询的目标总体上应该包括如下几点：
首先，学校心理咨询的目标之一是发展自我认识和控制能力。帮助学生形成、发展自我意识，认识和接纳自己，发展积极乐观的态度。让学生能够比较清楚地分辨自己的情绪体验并理解引起情绪的原因，能对个人的行为习惯、性格、能力进行自我分析，了解自己的长处与缺点。保持积极上进的心态，对未来充满希望，明确自己的目标和理想。遇到生活中的意外、挫折、压力时能保持情绪的相对稳定，对自己行为有较好的调整控制能力，能集中注意，坚持不懈地实现计划。
其次，学校心理咨询的目标还在于发展人际交往与合作的能力。帮助学生与周围人融洽相处，解决冲突，发展良好的关系。使学生乐于和别人交流，能认真地倾听他人的意见并理解他人，也能清楚地表达自己的意见和愿望；使他能够尊重他人，有责任心，关心他人的需要，愿意提供力所能及的帮助心理健康发展意味着善于和他人进行合作。在发展独立性的同时，也能学会和他人合作完成任务，知道互相激励、取长补短和分工配合，一起为共同的目标尽力：在和周围人发生冲突或分歧时懂得妥协，寻找彼此都能接受的解决办法。
除此之外，学校咨询的目标还包括：①发展学习能力。帮助学生设立自己在教育方面的目标，掌握和运用学习技能，有效地完成学习任务。②明确职业意识进行职业规划。帮助学生逐步明确职业方向，以便有目标地积累知识和发展自己的能力。分析自己的技能与兴趣，形成职业方面的理想（同一性），了解不同职业的特点，辅导学生进行职业决策、学习如何应聘工作等。③帮助有特殊需要的学生。对于极少数有严重的心理和行为障碍的学生，要进行早期诊断，如果可能要进行系统的矫正。如果治疗很困难，则要转送专门的治疗机构。
